被征收人不配合征收工作有兩種情況。

一種是達成了補償協議，但被征收人未按照補償協議約定履行搬遷義務?！秾嵤┘殑t》明確，被征收人不履行約定義務，經區房屋征收部門催告后仍不履行的，區房屋征收部門可以向被征收人作出履行補償協議決定，明確履行期限，告知行政復議、行政訴訟權利事項，并在房屋征收范圍內予以公告。被征收人在法定期限內未申請行政復議或者提起行政訴訟，且經催告仍不履行補償協議決定的，區房屋征收部門可以依法申請人民法院強制執行。

另一種是在征收補償方案規定的簽約期限內達不成補償協議。對此類情形，《實施細則》明確由區房屋征收部門報請區政府按照征收補償方案作出補償決定，并在房屋征收范圍內予以公告。被征收人對補償決定不服的，可以依法申請行政復議，也可以依法提起行政訴訟。被征收人在法定期限內不申請行政復議或者不提起行政訴訟，在補償決定規定期限內又不搬遷的，區政府發出催告書。被征收人自催告書送達之日起，10個工作日內仍不搬遷的，作出房屋補償決定的區政府可以依法申請人民法院強制執行。